La OACDH cuenta con oficinas de país en Angola, Bosnia y Herzegovina, Burundi, Camboya, Colombia, la Federación de Rusia, Guatemala, México, Nepal, Palestina, República Democrática del Congo, Serbia y Montenegro (incluido Kosovo) y Uganda. En 2006 y 2007, la OACDH tiene previsto abrir nuevas oficinas en Bolivia y Togo. Estos dos países se seleccionaron de acuerdo con los criterios establecidos en el Plan de Acción, a saber: la gravedad de la situación de los derechos humanos, las posibilidades de la OACDH de influir favorablemente en la situación, la capacidad de la OACDH de operar en virtud de un mandato amplio, y la voluntad del gobierno y de la sociedad civil para trabajar con la OACDH a fin de subsanar las deficiencias que afectan el cumplimiento de los derechos. La OACDH trabajará en el ajuste de sus actuales oficinas de país en Angola, Camboya, Colombia, Guatemala, México, Nepal y Uganda, y su oficina en Palestina, con miras a consolidar su labor y fortalecer su capacidad, de conformidad con la visión contenida en el Plan de Acción.
Las oficinas de Bosnia y Herzegovina y Serbia y Montenegro se cerrarán paulatinamente durante los próximos dos años, a excepción de la oficina de Kosovo, que será reforzada.