Durante su periodo de sesiones anual, la Junta de Síndicos examina los informes financieros y narrativos sobre la utilización de las anteriores subvenciones, hace recomendaciones sobre las nuevas solicitudes de subvención, se reúne con los donantes y con los responsables de los proyectos, realiza consultas al Relator Especial sobre la Tortura y al Comité contra la Tortura, así como hace cualquier otra recomendación pertinente sobre las actividades del Fondo que se somete posteriormente a la aprobación del Secretario General.

La 31 sesión de la Junta de Síndicos del Fondo se celebró en Ginebra de 19 a 23 de octubre de 2009. La Alta Comisionada de las Naciones Unidas para los Derechos Humanos aprobó, en nombre del Secretario General, las recomendaciones adoptadas por la Junta de Síndicos.

La Junta de Síndicos recibió solicitudes por un monto de más de 18,8 millones de dólares de los Estados Unidos y aprobó cerca de 11,9 millones de dólares de los Estados Unidos para nuevas subvenciones de 2010 que beneficiarán a más de 230 proyectos implementados por las organizaciones no gubernamentales en más de 70 países.